清太宗皇太极于六月十五率百官在沈阳祭太庙，尊奉其父野猪皮努尔哈赤为“承天广运圣德神功肇纪立极仁孝武皇帝”，庙号太祖；祖父到始祖都尊奉为王。十天后，皇太极大封其臣属。其诸兄弟子侄、诸外藩蒙古贝勒，及明降将孔有德、耿仲明、尚可喜都封为王。
之后皇太极的动作完全超出杨素的预料，刚刚称帝便即可出兵！令阿济格率十万大军攻打明朝，自己亲率五万军队攻打朝鲜，意图保住后方的安全，对抗在朝鲜驻守的明军。
锦衣卫刚刚从辽东送来皇太极命阿济格率军入关劫掠的消息，前线就传来战报，阿齐格就已经分三路奔向冀北，六月二十七日，阿济格兵分三路入喜峰口、独石口。
纵然杨素早已严令各方坚壁清野，将百姓回迁至城内，注意防守清兵入侵。但明朝早已腐烂到根子里，皇权不下乡是常态，但皇帝的命令地方官吏打折扣实施，却是让杨素也毫无办法。
明明已经下严旨，敢有不从者当即革职查办，事后更要交与锦衣卫追责问罪，但地府官吏不断找理由推诿拖拉，最后旨意被没有得到完全实施，不光面对清兵突然的入侵，毫无抵抗之力，更使百姓又遭一浩劫。
而独石口为外长城南北的交通要口，地势险要易守难攻，更是为长城要隘。为上谷之咽喉，京师之右臂！如此要塞居然被清兵半日而下，
巡关御史王肇坤拒战，兵败而死！黄得功奉杨素之命率军赶往独石口不曾想大军刚至半途，便得知独石口以破，不得已之下只能先命人飞马向杨素回报，之后率军退保昌平，以保卫京师重地！
京师戒严。杨素手上除黄得功之外无一大将可用，急令只能命方正化守龙泉关，急召卢象升、高起潜、秦良玉所部北上勤王。
几天后，又命王承恩领尚方宝剑巡视边关。五日，三路清兵齐齐会于京畿延庆，趁机攻打居庸关，居庸关天下雄关，短短一日便被清兵攻破，清兵在直隶省附近如入无人之境，天下震动！
崇祯九年七月十二日，清兵自天寿山后突现昌平城下，攻昌平城。明总兵巢丕昌作为内应降清，开昌平城门，大股清兵杀入昌平，幸好黄得功率部下拼死抵抗，将清兵逐出城内。否则京城左右再无险可守，京城便成为一座死城！
黄得功所部火器凶猛，清兵数度攻城不下，自身伤亡极大，阿济格见久攻不下，清兵入关主要还是为了劫掠明朝以弥补自身，不愿再与黄得功死磕，便命阿巴泰带兵继续围城，之后阿济格与扬古利继续带兵入京畿，又相继攻下良乡、此时正在围攻顺义。
如今京城已经内已经民心慌慌乱成一团，杨素当时得知独石口失守，便知晓清兵入关一时已成定局，光凭黄得功一部三万新练禁军，便是有燧发枪相助，想要野战战胜清军，简直是妄想。
当时顶住压力便强令尽迁京师附近数百万百姓入京城，一时间京城人满为患，幸亏杨素亲自出面城内暂时由禁军、锦衣卫统管，又以重典御之，连斩数百趁机作乱之人，这才将将稳住局势。
此时乾清殿内，京城内所有高级官吏齐聚，在此商议对策，温体仁率先向杨素进言：“皇上，臣请
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皇上立刻下旨召孙阁老率关宁铁骑入京勤王，驱赶清兵，以解京师之围！孙阁老对付满清十分有经验，八年前皇太极绕过关宁锦防线，进入长城以内，当时京师告急，又是在危殆时刻，孙阁老蒙皇上诏书起用，议守京师出镇通州，调度援军追击清军，重镇山海袭扰敌后，迫敌出塞收复四镇，再整关宁铁骑，臣以为此次对抗清兵，非孙阁老所不能！还请皇上下旨！”
“辽东事大，清兵只是一部入关，此时皇太极亲征朝鲜，辽东军不可轻动，否则若是清兵趁机攻占辽东，那我大明日后无险可守后果不堪设想，我京师有三大营外加禁军、亲兵驻守，稳如泰山！清兵绝无攻破的可能，臣以召卢象升、秦良玉、高起潜所部回京，此时以至保定，不日即将抵达京城，诸位勿忧！”杨素直接严词拒绝。
孙承宗此刻面临的压力绝对不小，杨素早已下密旨，不许他带兵回朝，还希望他不光能守住朝鲜，最好还能趁机侵扰清朝，清朝劫掠明朝，这次杨素面临的损失绝对不小，不过若是能使清朝也遭遇兵灾，食敌一钟，当吾百钟！双发互换之下，家大业大的杨素怎么都不会亏。
“皇上勤王大军还需一精明强干威望出众之人作为主帅，否则京师有各地兵马齐聚，若是不加以统御必生大乱，洪承畴为我大明兵部尚书，若论统帅大军非其莫属，况且洪承畴所部洪兵皆是我大明精锐，臣以为当急召洪承畴率洪兵勤王！再召各省道兵马进京！”钱士升亦是向杨素进言。
“臣附议，请皇上召洪承畴入京师勤王，召各省兵马进京！”
“臣等附议，请皇上下旨！”
在殿内的文武百官，听闻钱士升此言，皆是向杨素进言，请求杨素急召洪承畴入京。所有人都是怕死的，此刻没有谁会去管，若是连洪承畴都调走，那湖北一带的流寇会肆掠成什么模样，反正烂摊子和他们又毫无半点关系，谁会去在意那些百姓的死活。他们此刻只想着怎样保全住自己的身家性命，赶快送走清兵。
“不许！”杨素一拍桌子厉声反驳：“朕亲自坐镇京城，区区清兵岂能攻破京城？京城三大营有兵三十万，禁军有五万之众，加之卢象升与秦良玉所部，我大明军队足足有四十万之众，清兵不过十万而已，文武百官再有复言调兵勤王者，立刻革职查办！”
杨素一怒，百官皆低头静声而立，不敢再言。
“骆养性！”杨素唤道。
“臣在！”骆养性出列跪下。
“朕命令你率东厂、锦衣卫即可将京城内所有人登记造册，城内宵禁，不许有任何人私藏军械，不许任何人聚众，向各大商人、勋贵、官吏借粮，城内所有人最多只能留三月口粮，其余粮食皆借与朕，日后双倍归还！但有不从者，以通敌罪论处，诛九族！”杨素掷地有声的说道。
“臣遵旨！”骆养性领旨。
文武百官闻言先是想要出声拒绝，此事对他们影响极大，马上就要劝告杨素不要太极端，恐会激起民愤，不过之后听见杨素杀气腾腾的话，百官们顿时你望望我我看看你皆不敢作声，谁都知晓皇上此时是真的会动刀子的！谁都不敢做这出头鸟！