在小智成功地完成了露莎米奈交给他的任务后，库库伊博士找到了他，脸上洋溢着满意的笑容。库库伊博士说：“小智，你今天的表现真是太出色了。告诉你一个好消息，今晚将会有一场百年难遇的流星雨。天文台的台长特别邀请我们去观星，你有兴趣参加吗？”小智的眼睛立刻亮了起来，他兴奋地回答：“我非常想去，博士！”库库伊博士点了点头，说：“那就这么定了，下午在学校集合，希特隆也加入我们吧。”希特隆在一旁，虽然显得有些疲惫，但还是精神地回答：“好的，博士。”
小智和希特隆随后回到家后，希特隆立刻瘫倒在沙发上，沉声道：“可把我累坏了，一大早就出门，小智你的精力真是无穷无尽啊。”小智笑着摇了摇头，说：“希特隆，你这样可不行，我们还有很多事要做呢。”希特隆打了个哈欠，说：“我再睡会儿。”小智无奈地看了看希特隆，决定不再打扰他，便带着他的宝可梦们去了沙滩上进行特训。
下午时分，小智和希特隆准时来到学校，找到了库库伊博士和其他伙伴们。库库伊博士清点了一下人数，然后带领大家朝着天文台出发。随着夕阳西下，天空逐渐变得暗淡，小智他们也到达了天文台。天文台台长已经在门外等候着他们。库库伊博士热情地打招呼：“我们来了！”台长回应道：“库库伊，小玛！”众人疑惑地问：“小玛？”玛玛内有些尴尬地说：“我没有说过吗？这个天文台台长是我表哥哦。”众人惊讶地回应：“表哥？”水莲直言不讳地说：“长得太不像了。”玛玛内假装伤心地说：“你这么说，我很伤心的。”台长微笑着说：“你们可算来了，我是辉克拉尼天文台的马睿因，请多指教各位，那么各位跟着我来吧。”
在马睿因的带领下，众人来到了观星台上。远处的天空开始划过一串串流星，如同璀璨的珠宝。马睿因亲切地说：“看来流星雨要开始了，各位冲着流星许愿的话，愿望就会实现哦。”玛奥闭上眼睛，许下了愿望：“我希望家里餐厅越来越有名气！”卡奇也紧随其后：“我希望家人和宝可梦身体健康！”水莲则调皮地说：“盖欧卡我吊过了，我想吊只洛基亚！”小智坚定地说：“我要成为宝可梦大师！”希特隆则幽默地说：“我希望我以后的机器不再出现故障。”
随着众人许下愿望，流星雨也逐渐停止。玛玛内解释道：“其实那些流星本质上是小陨星啦，它们是生活在宇宙中的宝可梦哦。”马睿因点头说：“小玛说的不错，这次邀请你们来的目的呢，一方面是学习天文学的知识，另一方面就是观察小陨星哦。”于是马睿因带着小智他们来到天文望远镜这里，众人通过天文望远镜观察到了诸多星空奇观，也不免被这些景象震撼到了。在马睿因的一番讲解后，众人对天空充满了好奇，对宇宙的奥秘更加着迷。
此时，玛玛内兴奋地叫住了众人，他的眼睛里闪烁着期待。“各位，跟着我去看看小陨星吧！”小智好奇地观察着玛玛内，说道：“玛玛内看起来对这里很熟悉的样子啊。”马睿因微笑着解释：“因为小玛他啊，很小的时候就来过这里，还在这里呆过很长时间呢。”玛玛内带领着众人来到了一个名为流星山丘的地方。小智惊叹道：“哇，这里真的好炫酷啊，而且还有好多颜色的小陨星啊。”洛托姆在一旁补充道：“小陨星，流星宝可梦，岩石飞行属性，由沉重而又坚硬的外壳和内部的核心构成。外壳裂开后会变得轻盈。”
希特隆恍然大悟：“所以这就是小陨星的核心喽。”马睿因点头确认：“你说的不错，生活在宇宙中的小陨星靠吞食浮尘为生，它们将这些浮尘当做原材料，制作自己的外壳。”玛玛内接着说：“当然，能够落下来，就是因为外壳太重了。”小智若有所思地回应：“这样嘛。”马睿因继续解释：“它们的颜色是由使用的浮尘成分来决定的哦。”
随着时间的推移，小陨星们逐渐上升。小智疑惑地问：“它们这是要离开了吗？”突然，毒贝比大叫一声，众人跑过去查看情况。原来还有一只小陨星躺在草丛里。小智关心地问：“这只小陨星，怎么还没破壳？”毒贝比用尾巴敲了敲壳子，突然一阵光芒闪过，壳子裂开了，属实将众人吓了一跳。然后一只橙色的小陨星从壳中飘出。小智高兴地说：“出来啦你好小陨星！”小陨星一脸新奇地跟大伙打着招呼。但是小陨星随后就环绕着毒贝比，毒贝比也很开心的和小陨星互相玩耍着。马睿因观察着这一幕：“看起来，小陨星很喜欢毒贝比呢。”库库伊看了看天色：“各位时间不早了，我们先回天文台休息吧。”众人齐声回应：“好！”
于是小智带着小陨星，跟着众人回到了天文台。休息的时间，毒贝比都是抱着小陨星的，小智看着也羡慕起它们的感情。第二天毒贝比一起床就拉着小陨星出去玩耍了，小智和众人则围坐在桌边吃着早点，边看着它们玩耍边讨论起来。莉莉艾有些忧虑地说：“这孩子最后也会回到宇宙去吧。”卡奇安慰道：“应该会吧，要是像昨天那样有同伴来就好了。”马睿因提醒道：“今晚可是有大量的小陨星坠落哦。”小智兴奋地说：“真的吗，那我又期待了。”小智说完内心中又想起：“如果是这样，毒贝比应该会难过吧。”
吃完早点，其余人都跟着毒贝比和小陨星娱乐了起来，只有小智坐在草地上。此时库库伊走了过来，关切地问：“小智，怎么了，看你这样子感觉有心事啊。”小智忧心忡忡地说：“博士，你说如果小陨星离开了，毒贝比会不会难过啊。”库库伊温柔地回答：“你在考虑这个事情啊，好友的离开多多少少确实会让人难受，但是也为我们留下了美好的记忆啊。与其悲伤离别，不如去多创造一点美好的回忆，不是吗。”小智释然：“谢谢你博士，我明白了。”
晚间，马睿因所说的更为宏大的流星雨开始了。众多的小陨星从天而降，也有众多小陨星褪去外壳浮上天空。目光所及之处都是亮闪闪的一片。但是随着小陨星们缓缓上升，一只接着一只的小陨星逐渐消散。小智不解地问：“这是怎么回事？”马睿因沉重的说道：“失去外壳的小陨星，最后都是会消散的。”小智焦急地问：“就没有办法挽回吗？”马睿因摇了摇头：“这就是小陨星这种宝可梦的命运啊。也意味着毒贝比不得不面对橙色小陨星的消散。”小智看着因橙色小陨星消散而悲伤的毒贝比，心里不免还是有点难受。
库库伊拍了拍小智：“在我们脑海中，存留的点滴记忆，就是我们度过美好时光的证明了。”小智感慨地说：“博士。。。”毒贝比飞了下来，和小智比划着似乎要表达自己的情绪，小智则抱住了毒贝比。
此时希特隆大叫一声：“你们快看。”埋头悲伤的小智和毒贝比听到这个声音，也连忙抬起头。只见在夜空中，一只巨大的宝可梦在亮光中穿梭。小智惊喜地喊道：“是裂空座！”众人也兴奋地回应：“真的见到了”“好棒啊。”小智猜测：“裂空座这是来迎接小陨星们嘛。”玛玛内点头：“应该是的，毕竟裂空座也是生活在宇宙中的呀。”小智感慨地说：“说的也是。”在这个夜晚，他们见证了小陨星的生命周期，也体会到了生命的美好与无常。